Curso Online de Ferramentas de Bioinformática e Mineração de Dados

Autor(a): Leandro De Oliveira Silva

Carga horária: 16 horas

Por: R$ 25,00
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O presente curso destina-se a apresentar ferramentas de Bioinformática aplicáveis a estudos de genômica de plantas, in silico, assim como conceituar Mineração de dados biológicos e a área de atuação do Bioinformata. Ao longo do curso, são mostrados exemplos práticos do uso das ferramentas, de forma a instrumentalizar o cursista a aplicar os conhecimentos em seus estudos.

Vantagens
Saiba Mais

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Frente

Verso

Ferramentas de Bioinformática
e Mineração de Dados

Uma introdução aos estudos gênicos in silico
Sumário

Leitura recomendada
Apresentação do curso
Objetivos

Capítulo 1 Bioinformática aplicada à Biologia Molecular

Capítulo 2 Metodologia Científica Básica

Capítulo 3 Era pós-Genoma e Bases de dados de plantas

Capítulo 4 Mineração de dados e Ferramentas de Bioinformática

Capítulo 5 Área de atuação do Bioinformata

Avaliação do Curso
Disponível em: https://www.ufrgs.br/bioinfo/ebook/

Leitura Recomendada Bioinformática: da Biologia a Flexibilidade Molecular
Apresentação

A Bioinformática, enquanto campo relativamente desconhecido da Biologia, atrai cada vez mais o olhar de estudantes e pesquisadores das mais diferentes sub-áreas, gerando uma demanda por profissionais qualificados. Por causa disso, o presente curso tem como objetivo introduzir o tema Bioinformática, mais especificamente as ferramentas que podem ser utilizadas para os estudos de Biologia Molecular, in silico, de genes de plantas. Por se tratar de uma área muito extensa, repleta de possibilidades e que se renova a cada dia, este curso não pretende esgotar o conteúdo, mas fomentar discussões e apresentar sugestões de abordagens.

Esperamos que esse curso contribua para a atualização de egressos do curso de Ciências Biológicas e afins, e desperte o interesse para um mundo de possibilidades.

Bons estudos!
Objetivos:

Apresentar a Bioinformática aplicada à Biologia Molecular;

Explicar o conceito de Mineração de Dados;

Apresentar exemplos práticos do uso de ferramentas de Bioinformática na identificação e caracterização de genes;

Apresentar o campo de atuação do Bioinformata
Nosso curso

Bioinformática

Capítulo 1 Bioinformática aplicada à Biologia Molecular

A Bioinformática é uma área muito extensa. Neste curso abordaremos apenas uma pequena parte, como se fosse a ponta de um iceberg. Além disso, a Bioinformática é uma área em constante evolução, pois é movida por programas que são sempre atualizados ou substituídos.

Logo, não existe um curso definitivo, ou mesmo um que aborde a totalidade das aplicações da Bioinformática.

https://chopinhofeminino.blogspot.com/2012/03/icebergs-gelatinosos.html
Daí vem a importância de se estar sempre atualizado, pois uma ferramenta utilizada atualmente pode ser rapidamente substituída por outra com melhor desempenho. Também é muito importante para o Bioinformata conhecer o Linux, pois um grande volume de dados é processado em computadores por uso do terminal de comando.

Antes de prosseguirmos, porém, tente responder à seguinte pergunta:

O que é Bioinformática?

Terminal de comando do GNU-LINUX.

https://pt.wikipedia.org/wiki/Linux

https://www.vivaolinux.com.br/dica/Terminator-o-Terminal
Veja alguns conceitos abaixo:
Como você deve ter observado, existem diferentes conceitos para a Bioinformática. Contudo, eles têm em comum:

a aplicação junto a um ser vivo (ou in silico, a partir de informações que derivam dele);

o uso de ferramentas computacionais

Bioinformática, portanto, é a interpretação de dados originados a partir de seres vivos, pelo uso de ferramentas computacionais.

Vamos ver como tudo isso começou?

https://pt.wikipedia.org/wiki/Computador_pessoal

http://lenicesistemasolar.blogspot.com/2012/08/diversidade-dos-seres-vivos-plantas.html
Breve História da Bioinformática

A Bioinformática tem suas origens uma década antes do sequenciamento do DNA se tornar viável, e tem como principais marcos históricos:

Publicação da estrutura do DNA - 1953

Graças aos trabalhos de Rosalind Franklin, James Watson e Francis Crick, a estrutura do DNA foi desvendada e publicada na revista Nature, em 1953.

Posteriormente, o desenvolvimento de computadores possibilitaria o desenvolvimento de diversos estudos.

https://br.pinterest.com/pin/23714335509068576/
Acúmulo de informações acerca de proteínas dos estudos de:

Pauling

Ramachandran

Os estudos de Pauling definiram o que se entende por ligação química, revolucionando os estudos da Química. Por estes estudos, recebeu o Nobel de Química de 1954, e o da Paz em 1962. Publicou diversos estudos sobre proteínas, aminoácidos e peptídeos.

Vilayanur S. Ramachandran é um bioquímico hindú, responsável pelo gráfico de Ramachandran, o qual permite visualizar todas a combinações possíveis dos ângulos de aminoácidos de um polipeptídio. Esse gráfico é utilizado para validar estruturas modeladas computacionalmente.

http://turma962011ngs.blogspot.com/2011/11/sao-varias-as-contribuicoes-de-linus.html

https://www.ted.com/speakers/vilayanur_ramachandran